Dans le cadre de la négociation nationale, le Conseil fédératif de négociation (CFN) précise les grandes orientations de la Fédération autonome de l’enseignement (FAE) et exerce le contrôle politique de la négociation. Il traite également de toute question liée à la négociation nationale ou à une modification de la convention collective. Le CFN est composé des membres du Comité exécutif de la FAE et des délégations de chacun des affiliés. Cette instance est réunie à chaque étape du processus de négociation, et seules les personnes membres visées par une même convention collective peuvent se prononcer. Sa composition et son fonctionnement sont semblables à ceux du Conseil fédératif de la FAE.